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Amenorréia primária normalmente ocorre mais devido um atraso da puberdade do que é um problema permanente. As causas deste atraso normalmente não são conhecidas, mas pode ser devido problemas hereditários, defeitos genéticos como Síndrome de Turner, distúrbios hormonais como disfunções tireoidiana. Gravidez, é a maior causa de amenorréia secundária mas a menstruação pode parar devido: período de amamentação, uso de pílulas anticoncepcionais que controlam descargas hormonais como impregnação por acetato de medroxiprogesterona. Nestes caso a menstruação voltará dentro de 3 a 6 meses. Amenorréia secundária também pode ocorrer devido: stress, depressão, desnutrição, uso de drogas como tranqüilizantes ou antidepressivos, perda ou ganho rápido de peso, doença sistêmica crônica como insuficiência renal ou câncer, excesso de exercícios físicos, cirúrgias recentes, desequilíbrios hormonais como na Síndrome do ovário policístico.

Amenorréia não é uma doença, é um sinal de que a saúde da mulher não está boa. Normalmente ela é causada por algum desequilíbrio hormonal que pode acarretar outros sintomas como: ganho de peso, excesso de pêlos no corpo no rosto, saída de secreção pelos seios, acne.

Amenorréia normalmente não é uma ameaça a vida, mas pode estar associada a alguns problemas de saúde. Quando a mulher refere ao médico estar apresentando falha do período menstrual, ele deverá retirar uma história detalhada sobre medicamentos utilizados por ela, além de realizar um exame fisíco detalhado. O médico também deverá solicitar exames como: teste de gravidez, exames de sangue específicos para meninas que com 14 anos ainda não desenvolveram mamas nem pêlos pubianos, exames de sangue em casos que a mulher apresentar saída de secreção pelas mamas, dores de cabeça, alterações visuais, excesso de pêlos pelo corpo e no rosto, excesso de peso. Estes exames podem quantificar: HCG, hormônio que é marcador da gestação; FSH, hormônio folículo estimulante que regula o ciclo menstrual; nível de estradiol, principal estrógeno do corpo; função tireoidiana; prolactina, hormônio que estará aumentado em alguns tumores e anormalidades da tireóide; anormalidades cromossômicas que impedem a menstruação. Tumores de glândula pituitária podem elevar os níveis de prolactina, podendo ser diagnosticados através de raio-x especiais.

Se a amenorréia está ocorrendo a menos de 6 meses, a mulher não necessita de tratamento a não ser que algum problema seja encontrado nos seus níveis hormonais, no raio-x ou no ultra-som. O tratamento varia de acordo com a causa da amenorréia. Dieta e exercícios corrigem alterações menstruais devido obesidade. Controle de stress e não exagerar nos exercícios físicos também ajudam. Se o ovário não estiver produzindo hormônios, ela deverá fazer uso de pílulas anticoncepcionais pois contêm hormônios; se tiver entrado na menopausa recentemente, deverá fazer uma terapia de reposição hormonal com pílulas de progesterona ou agentes indutores da ovulação como clomifeno. Pílulas anticoncepcionais e a Terapia de reposição hormonal podem ser de estrógeno com progesterona ou só de progesterona, elas ajudam a induzir menstruação e previnir desgaste ósseo.

Cirurgias são indicadas em casos de: tumores de ovário, malformações uterinas ou da vagina e raramente são realizadas quando existe anomalias cromossômicas. Quando uma mulher jovem tem amenorréia, se diagnosticada precocemente sua menstruação poderá retornar em poucos meses somente com utilização de hormônios, não necessitando de cirurgia. Mulheres que desejam engravidar e seu único problema é não ovular, apresentam 70% a 80% de chance de sucesso no tratamento. Após parar de usar pílulas anticoncepcionais algumas mulheres podem ficar sem menstruar por 2 a 3 meses, ou até por um ano. Se por acaso ela apresentar algum período de stress ou alguma doença que provocou a parada da menstruação, o problema poderá se resolver sem necessidade de uso de hormônios.